肠道全菌群多样性健康咨询 Intestinal Microflora Diversity Analysis and Consulting
DGGE等分子生物学方法及生物芯片对肠道菌群进行研究存在一定的缺陷。如DGGE只能检测到环境样品中十几种优势菌，但是对痕量微生物却束手无策。DCGE中，电泳条带中包含不只一种16SrDNA序列，要获悉具体的菌种信息，还需进行克隆、测序，实验操作繁琐；此外，采用这种方法不能反映微生物的丰度情况。而生物芯片通过固定在芯片上的探针来获得微生物多样性的信息，“只能验证已知，却无法探索未知”，通过信号强弱判断微生物的丰度也不是非常的准确。新一代高通量测序技术以其数字化信号、高数据通量、高测序深度、高准确率等特点，已被广泛的应用于肠道菌群的研究中。高通量测序法分析菌群可以分析包括痕量微生物在内的大多数菌种，也能发现菌群中未知菌种，数据准确全面可靠。
■分析项目：
●肠道细菌菌群多样性(香农曲线)；
●肠道细菌Top20菌属分析(可以扩展到前50种)；
●肠道细菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析、综合健康建议;
■分析样品
10克新鲜或妥善保存的粪便；
■采样注意事项：
需要按指导说明操作；
■报告周期：15-20天
肠道菌群多样性：
用来分析肠道菌属种类是否多样的统计学方法，式整体上对菌群情况的分析。横坐标代表测序读数OTU的序数，纵坐标代表该测序OTU的丰度值；每条折线代表某一物种的测序读数OTU丰度分布，每种物种的丰富程度由曲线在横轴上的长度来反映，曲线跨度越大表示物种的组成越丰富；物种组成的均匀程度由曲线的形状来反映，曲线越平坦，表示总体物种组成的均匀度越高。
16srDNA测序：
16SrDNA分析，是指用利用细菌16SrDNA序列测序的方法对细菌进行种属分析。包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。是一种快速获得细菌种属信息的方法。
常见的益生菌和有害种属：
几种常见有益菌和常见有害菌按照菌的属（细菌分类有门、纲、目、科、属、种等级）。乳杆菌属 Lactobacillus、双歧杆菌属 Bifidobacterium、大肠埃希氏菌Escherichia、柠檬酸杆菌属Citrobacter为常见无害的菌群种类；其中乳杆菌和双歧杆菌为常见的益生菌。韦氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、变形杆菌proteus species、假单胞菌Pseudomonada- ceae、韦荣氏球菌属 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoniae为常见可能出现有害菌的菌属。志贺氏菌属 Shigella Castellani、 沙门菌属Salmonella 为著名有害菌属。
分析后干预：
1）补充必要的商业化益生菌：缺少双歧杆菌属的补充双歧杆菌属，缺少乳杆菌的可以合理补充嗜酸乳杆菌等乳杆菌、植物乳杆菌类益生菌。
2）肠道菌群alpha多样性下降的人群合理多样化饮食；
3）肠道菌群alpha多样性下降的人群合理其他肠道营养如谷氨酰胺、N-乙酰氨基葡萄糖、肠道消炎补充剂、短链脂肪酸等肠道营养加快健康肠稳态的形成；
4）如发现潜在或重要有害菌，作为医生治疗肠道疾病的重要参考；
此分析可提供的重要信息如下：
●肠道细菌菌群多样性；
●肠道细菌Top20菌属分析；
●肠道细菌各主要菌群的含量排序；
●主要有益和有害菌的分析；
●分析后健康建议；
检测报告报告范例：
说明：几种常见有益菌和常见有害菌按照菌的属（细菌分类有门、纲、目、科、属、种等级）。乳杆菌属 Lactoba- cillus、双歧杆菌属 Bifidobacterium、大肠埃希氏菌Escherichia、柠檬酸杆菌属Citrobacter为常见无害的菌群种类； 其中乳杆菌和双歧杆菌为常见的益生菌。韦氏梭菌(Clostridium Wellchii)、葡萄球菌Staphylococcus、变形杆菌proteus species、假单胞菌Pseudomonadaceae、韦荣氏球菌属 Verllonella、肺炎克雷伯菌 klebsiella pneumoni- ae为常见可能出现有害菌的菌属。志贺氏菌属 Shigella Castellani、 沙门菌属 Salmonella 为著名有害菌属。
主要20种菌简要分析（此分析将根据个人差异进行智能化个性分析）
检测指标与简明分析：
1.双歧杆菌Bifidobacterium,常见的一种益生菌,具有抗肿瘤、增强免疫、改善胃肠道、抗衰老作用，占42.86%;
2.拟杆菌属Bacteroides，化能有机营养的专性厌氧杆菌，占14.81%;
3.瘤胃菌属 Ruminococcaceae_UCG-014, 凝固型苦荞酸奶降低此菌丰度；合生元治疗慢性功能性便秘后此菌丰度上升，黄芩汤对溃疡性结肠炎大鼠治疗后，此菌丰度增加，占9.86%;
4.普氏粪杆菌Faecalibacterium，可以产生丁酸，一般具有抗炎作用，占6.73%;
5.扭链瘤胃球菌 Lachnospira,为一种潜在的有益菌, 可发酵葡萄糖的产物包括甲酸、乳酸、乙酸、乙醇、CO2和H2。发酵果胶的产物与葡萄糖的相同并产甲醇。幼儿若此菌丰度过低，在3岁时更容易被诊断患有哮喘，占3.13%;
6.[Eubacterium]_rectale_group菌，目前研究较少，功能未知，占2.29%
7.另枝菌属 Alistipes,与氧化三甲胺TMAO有关，也与肠易激综合症相关，占1.77%;
8.巴恩斯氏菌Barnesiella，可促进环磷酰胺诱导的治疗性免疫调节效果，占1.6%;
9.瘤胃球菌科Ruminococcus_2，合生元治疗慢性功能性便秘后此菌丰度降低，占1.59%;
10.副杆菌属Parabacteroides，生酮饮食提高Parabacteroides菌的丰度，科学家们怀疑这种细菌是提供抗癫痫保护的关键；此菌与肠易激综合症负相关，占1.58%;
11.真杆菌属成员[Eubacterium]_coprostanoligenes_group，一种产粪甾醇真细菌，它能将胆固醇分解为不能被吸收的粪甾醇,随着粪便排出体外，粪甾醇的比例能达到50%。这就意味着，肠道内有此产粪甾醇真细菌的人吃下高胆固醇食物后吸收的部分比其他人要少一半，占1.4%;
12.瘤胃菌科Ruminococcus_1，此菌在相对丰度显著在肾结石患者中显著降低，占1.21%;
13.罕见小球菌属 Subdoligranulum,来自人类排泄物中的新属，该菌体能利用许多糖类物质（即N-乙酰-D-葡萄糖胺，N-乙酰-D-甘露糖胺等可肠道内发酵产生短链脂肪酸，是益生菌，占0.93%;
14.凸腹真杆菌[Eubacterium]_ventriosum_group，孕期增重过量人群此菌减少，占0.91%;
15.考拉杆菌属 Phascolarctobacterium,通常是一种有益的菌，此菌丰度高的人容易减肥，占0.81%;
16.柯林斯氏菌 Collinsella,与脂质代谢异常、II型糖尿病正相关，占0.72%;
17.萨特氏菌属Sutterella，超过一半的伴有胃肠功能障碍的自闭症儿童肠道中发现此菌，此外此菌在腹泻动物模型中显著上升，占0.59%;
18.链型杆菌属Catenibacterium，慢性功能性便秘患者中此菌减少。高心血管风险的患者肠道缺少此菌；此菌在终末期肾病患者中显著减少；多囊卵巢综合征患者肠道中此菌和Kandleria菌属丰度增加；长期在岛屿上的老年妇女体内容易富集此菌；黎族人肠道容易富集此菌，占0.57%；
19.真杆菌属成员[Eubacterium]_ruminantium_group，反刍动物真杆菌，对机体有营养、生物拮抗和维持肠道微生态平衡功能, 慢性功能性便秘患者肠道此菌增多，占0.48%;
20.毛螺菌科Lachnospiraceae的一种未分类菌Lachnospiraceae_unclassified, 一类通常在人类肠道和其他的哺乳动物肠道中发现的细菌，占0.42%;
3.3菌群个性化综合分析:
本次总读数为68562，达到测序极限，分析样品排名前20的菌属见18页。
将菌群多样性分为“差，一般，良好，好，非常好”，则该个体肠道菌群整体菌属的种类一般，多样性一般；
就熟知的有益菌而言，如双歧杆菌属等含量非常高，与长期补充单一富含此菌的益生菌有关，但其他常见的益生菌属如考拉杆菌、乳杆菌等也缺少。双歧杆菌是一种生理性有益菌，对人体健康具有生物屏障、营养作用、抗肿瘤作用、免疫增强作用、改善胃肠道功能、抗衰老等多种重要的生理功能。调整肠道菌群平衡，抑制肠道不良微生物的增殖。嗜酸乳杆菌对致病微生物具有拮抗作用。嗜酸乳杆菌能分泌抗生物素类物质(嗜酸乳菌素(acidolin)、嗜酸杆菌素(acidophilin)、乳酸菌素(laetocidon), 对肠道致病菌产生的拮抗作用。
此虽然个体也含有一些其他常见的有益的菌属，如普氏粪杆菌Faecalibacterium，总体而言，各类有益菌属种类多样性不够。建议还可以补充嗜酸乳杆菌等乳杆菌、植物乳杆菌等多种已有的商品化益生菌; 同时，合理选择富含膳食纤维的食物和合理使用各种益生元，尽快促进健康肠稳态的建立。
测序分析表明该个体含有的常见潜在有害菌属较少。测序结果还提示，该个体与II型糖尿病风险相关菌属很多；与肥胖、肠易激综合症、中风，慢性肾病，便秘风险相关的菌属也较多，建议用户加强此类病的预防和健康管理。综合以上分析，建议个体采取有力措施，维持肠道菌群的多样性。
